22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1924 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  100 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  56.19 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  68 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  56.7 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  54.82 
 
 		 221 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  62.89 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  63.4 
 
 		 218 aa  202  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  50.48 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  57.82 
 
 		 213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  51.2 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  46.24 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  36.73 
 
 		 162 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  37.68 
 
 		 84 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 87 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 85 aa  43.5  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 102 aa  43.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  30.3 
 
 		 243 aa  42  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  32.35 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  32.35 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5035  peptidase M23B  42.86 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>