51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2434 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  42.14 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  36.75 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  30.94 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  32.41 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  31.21 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  40.95 
 
 		 266 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  34.86 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  30.82 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  31.3 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  32.58 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  31.36 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  31.18 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 88 aa  47.8  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  37.97 
 
 		 85 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.58 
 
 		 175 aa  47.8  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  32.93 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  39.39 
 
 		 82 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 88 aa  45.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 85 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 85 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  38.89 
 
 		 88 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 85 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  36.47 
 
 		 85 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  31.58 
 
 		 88 aa  45.1  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  28.09 
 
 		 133 aa  45.1  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.06 
 
 		 84 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  28.4 
 
 		 125 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  35.53 
 
 		 84 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  35.06 
 
 		 84 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  32.47 
 
 		 84 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  32.47 
 
 		 84 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  32.47 
 
 		 84 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  34.18 
 
 		 85 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2024  glutaredoxin  35.38 
 
 		 92 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  32.89 
 
 		 86 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.44 
 
 		 85 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  28.28 
 
 		 115 aa  42  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1542  glutaredoxin 3  32.56 
 
 		 89 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.458759  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  35.9 
 
 		 85 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  32.05 
 
 		 86 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  27.96 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  29.85 
 
 		 77 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  29.85 
 
 		 77 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  35.94 
 
 		 106 aa  41.6  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1319  hypothetical protein  33.77 
 
 		 85 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  34.18 
 
 		 89 aa  41.2  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  29.07 
 
 		 122 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  30.77 
 
 		 84 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  33.33 
 
 		 80 aa  40.8  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  26.67 
 
 		 539 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>