53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2919 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  100 
 
 		 134 aa  261  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  26.98 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  36.25 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  33.7 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  28 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  34.57 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  30.89 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  27.13 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  41.67 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  34.15 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  35.06 
 
 		 391 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  37.04 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0113  glutaredoxin  47.5 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  24.59 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.23 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  30.49 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  28.4 
 
 		 80 aa  48.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  26.58 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  32.05 
 
 		 229 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  27.85 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  31.18 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  35.06 
 
 		 398 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  28.75 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.1 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10960  hypothetical protein  28.7 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.262634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  36.47 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.86 
 
 		 383 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.21 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4712  glutaredoxin-like protein  31.4 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  38.2 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.86 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.86 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.65 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  28.75 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  41.46 
 
 		 382 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  28.28 
 
 		 205 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  28.21 
 
 		 83 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  27.38 
 
 		 266 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  27.63 
 
 		 221 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  34.29 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  26.04 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  32.5 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.21 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  26.92 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  27.96 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  27.84 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  35.71 
 
 		 402 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>