46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3985 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  100 
 
 		 266 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  51.23 
 
 		 221 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  62.58 
 
 		 213 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  63.51 
 
 		 218 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  49.75 
 
 		 229 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  62.84 
 
 		 218 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  51.43 
 
 		 211 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  46.8 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  53.64 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  46.41 
 
 		 211 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  46.75 
 
 		 205 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  33.96 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.26 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  27.43 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  36.23 
 
 		 78 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  31.94 
 
 		 168 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  28.72 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  37.31 
 
 		 384 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  31.82 
 
 		 87 aa  45.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 92 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.14 
 
 		 83 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  24.78 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  24.78 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  24.78 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  32 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  38.89 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  33.85 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  33.85 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  26.39 
 
 		 78 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 77 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 77 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  31.94 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  31.25 
 
 		 84 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.38 
 
 		 85 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  27.85 
 
 		 134 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 133 aa  42.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 85 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  30.26 
 
 		 398 aa  42.4  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  34.92 
 
 		 85 aa  42  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  32.1 
 
 		 191 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 		 82 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>