24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2130 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  100 
 
 		 218 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  98.62 
 
 		 218 aa  425  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  70.86 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  58.91 
 
 		 221 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  62.94 
 
 		 211 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  59.09 
 
 		 229 aa  215  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  57.51 
 
 		 221 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  53.17 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  58.78 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  49.4 
 
 		 211 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  48.88 
 
 		 205 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  38.16 
 
 		 162 aa  99.4  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  45.1  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 84 aa  45.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  35.06 
 
 		 85 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  32.43 
 
 		 95 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  34.57 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.27 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 77 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 77 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  30.11 
 
 		 89 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  34.78 
 
 		 84 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 87 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>