89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2457 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  100 
 
 		 213 aa  414  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  62.1 
 
 		 218 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  63.02 
 
 		 211 aa  228  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  62.1 
 
 		 218 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  63.4 
 
 		 221 aa  221  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  55.21 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  59.09 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  61.01 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  60.69 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  49.71 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  45.26 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  34.9 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  31.54 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 85 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 84 aa  48.9  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  31.4 
 
 		 86 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28.05 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36 
 
 		 80 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  30.11 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 85 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  28.12 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 85 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  32.56 
 
 		 87 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  31.75 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 85 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 85 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  32.88 
 
 		 83 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  39.71 
 
 		 84 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  35.82 
 
 		 84 aa  45.1  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  30.3 
 
 		 101 aa  45.1  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 85 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  34.33 
 
 		 84 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  30.34 
 
 		 89 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  31.08 
 
 		 95 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.95 
 
 		 87 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 102 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  33.33 
 
 		 88 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  29.55 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 77 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 77 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.77 
 
 		 86 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  31.46 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  31.82 
 
 		 80 aa  43.5  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3153  glutaredoxin-like protein  34.38 
 
 		 84 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00125974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  35.94 
 
 		 85 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  31.4 
 
 		 86 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36.36 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  34.33 
 
 		 84 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  29.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3917  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0970287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3206  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  42.7  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1010  glutaredoxin-like protein NrdH  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02493  hypothetical protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2795  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0109554 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1033  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2809  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02529  glutaredoxin-like protein  38.1 
 
 		 81 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  34.85 
 
 		 103 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  38.81 
 
 		 84 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 86 aa  42.4  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  32.84 
 
 		 85 aa  42  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 89 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  35.29 
 
 		 84 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  28.79 
 
 		 101 aa  42.4  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  29.85 
 
 		 442 aa  42  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4197  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 89 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1167  glutaredoxin  41.18 
 
 		 77 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.957373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1145  glutaredoxin  41.18 
 
 		 77 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3005  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424268 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2988  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0820177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2953  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443282  normal  0.0122925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2922  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4157  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 89 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3111  glutaredoxin-like protein  33.87 
 
 		 81 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.530275  normal  0.463603 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 85 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>