19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2133 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  401  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  46.91 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  46.56 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  46.77 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  50.34 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  48.39 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  43.32 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  50 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  50.71 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  46.43 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  48.1 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  34.46 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  30.82 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  38.96 
 
 		 84 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.49 
 
 		 175 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  24.26 
 
 		 243 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  24.46 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  32.31 
 
 		 81 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  29.63 
 
 		 121 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>