94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0884 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  100 
 
 		 121 aa  252  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  90.98 
 
 		 122 aa  227  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  58.82 
 
 		 125 aa  140  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  54.92 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  53.66 
 
 		 123 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  41.67 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  36.71 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  31.52 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  39.47 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.53 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  34.57 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  38.67 
 
 		 80 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  36 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  39.47 
 
 		 398 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  40 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.88 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  34.72 
 
 		 384 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  32.5 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  32.47 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  30.89 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  32.26 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  34.21 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.77 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  40.26 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  37.31 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  34.21 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  35 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  37.29 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  35.62 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  36.21 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  35.38 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  33.85 
 
 		 168 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  36.11 
 
 		 402 aa  47.8  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  32.47 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2739  hypothetical protein  24.39 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.86 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  32 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  30.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  33.33 
 
 		 213 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  36.84 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  31.58 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35.29 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  31.76 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  33.66 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  28.77 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  32.14 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0131  thioredoxin domain-containing protein  30.36 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000222115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  34.48 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  33.33 
 
 		 229 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  32.84 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  27.06 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  29.33 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  30.26 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  30.51 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2255  hypothetical protein  30.88 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.76 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0860  hypothetical protein  28.21 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  30.51 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  28.77 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  31.17 
 
 		 191 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  32.56 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  35.44 
 
 		 260 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 89 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  33.9 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2226  hypothetical protein  30.88 
 
 		 84 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  28.95 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  35.09 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  32.2 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  29.63 
 
 		 205 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  30.12 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  33.9 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  30.16 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  31.03 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  30.26 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  28.99 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  30.12 
 
 		 266 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1553  hypothetical protein  34.62 
 
 		 187 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0385592 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0591  hypothetical protein  31.82 
 
 		 220 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  32.2 
 
 		 59 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>