15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2237 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  263  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3164  hypothetical protein  41.94 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.613757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  26.72 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  25 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  28.92 
 
 
123 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  28.18 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  28.35 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  32.43 
 
 
168 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  26.72 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  30.38 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  25.45 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  29.7 
 
 
191 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  30.67 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  30.12 
 
 
82 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  29.11 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>