196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2959 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  100 
 
 		 168 aa  348  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  75.61 
 
 		 83 aa  145  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  53.33 
 
 		 191 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  39.22 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  40.51 
 
 		 116 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  39.02 
 
 		 116 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  44.62 
 
 		 70 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  39.51 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  36.84 
 
 		 106 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  26.88 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  34.69 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  35.37 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  35.53 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  39.19 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  37.84 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  39.13 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  36.99 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  42.42 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  27.33 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  36.11 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  37.33 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  35.62 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  30.16 
 
 		 81 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  37.68 
 
 		 84 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2898  glutaredoxin-like protein  47.46 
 
 		 86 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0792197  normal  0.021739 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  42.11 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  34.33 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3793  glutaredoxin-like protein GlrX  42.86 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.565911  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  35.53 
 
 		 391 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  26.39 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  32.95 
 
 		 122 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  46.55 
 
 		 88 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  36.23 
 
 		 84 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  42.03 
 
 		 91 aa  51.6  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 80 aa  51.2  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  31.94 
 
 		 76 aa  51.2  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4661  glutaredoxin-like protein  48 
 
 		 83 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.319136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0934  glutaredoxin-like protein  42.59 
 
 		 79 aa  50.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0764967  normal  0.602871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  30.3 
 
 		 121 aa  50.8  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1772  glutaredoxin-like protein  45.61 
 
 		 89 aa  50.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.16885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1178  glutaredoxin-like protein  37.93 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.975615  normal  0.0647331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  30.43 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  41.27 
 
 		 85 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0785  glutaredoxin-like protein  40.35 
 
 		 81 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  30.21 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  31.94 
 
 		 266 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  39.06 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  39.68 
 
 		 89 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  37.29 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1408  glutaredoxin-like protein GlrX  44.9 
 
 		 82 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.611823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27570  Glutaredoxin-like protein  41.38 
 
 		 92 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1426  glutaredoxin-like protein  44.9 
 
 		 82 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  30.56 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  39.06 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1462  glutaredoxin-like protein  44.9 
 
 		 82 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.200853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  38.1 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  41.07 
 
 		 87 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3048  glutaredoxin-like protein  47.92 
 
 		 79 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.196094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  34.72 
 
 		 80 aa  48.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1806  glutaredoxin-like protein  47.06 
 
 		 83 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.236258  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  37.29 
 
 		 85 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2967  glutaredoxin-like protein  33.8 
 
 		 82 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  40 
 
 		 86 aa  47.8  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  39.39 
 
 		 94 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3744  glutaredoxin  46.3 
 
 		 93 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00746717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  33.78 
 
 		 221 aa  47.4  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 84 aa  47.4  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  33.33 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  30.38 
 
 		 113 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  35.29 
 
 		 81 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  40.32 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  39.68 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  33.33 
 
 		 81 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  41.27 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  39.06 
 
 		 89 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  37.1 
 
 		 84 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 80 aa  46.6  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 85 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  41.27 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  35.53 
 
 		 96 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  30.14 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3497  glutaredoxin-like protein  45.28 
 
 		 94 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0397961  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 95 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  32.2 
 
 		 86 aa  45.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1785  glutaredoxin-like protein  47.92 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.593811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  27.4 
 
 		 128 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  31.94 
 
 		 402 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7800  glutaredoxin  51.52 
 
 		 84 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>