75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3366 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  100 
 
 		 191 aa  400  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  61.45 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  60.76 
 
 		 83 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  47.22 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  44 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  40.51 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  42.86 
 
 		 70 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  32.5 
 
 		 127 aa  62  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  28.8 
 
 		 126 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  39.44 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  39.39 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  37.5 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  29.49 
 
 		 402 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  32.89 
 
 		 384 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 125 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  33.33 
 
 		 81 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  32.89 
 
 		 78 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30.67 
 
 		 383 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1969  hypothetical protein  42 
 
 		 58 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  32 
 
 		 80 aa  49.3  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  32.89 
 
 		 147 aa  49.7  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 80 aa  48.9  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  31.17 
 
 		 81 aa  48.5  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  36.76 
 
 		 391 aa  48.5  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  35.14 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0976  glutaredoxin  32.79 
 
 		 105 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 80 aa  46.6  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  35.21 
 
 		 85 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  34.92 
 
 		 85 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0563  glutaredoxin-like protein NrdH  30 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629127  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  39.71 
 
 		 90 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0529  glutaredoxin-like protein GlrX  34.48 
 
 		 86 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  28.57 
 
 		 83 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  35.29 
 
 		 81 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02143  glutaredoxin  31.51 
 
 		 75 aa  45.1  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0606  glutaredoxin  31.34 
 
 		 97 aa  44.7  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 82 aa  44.7  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  28.17 
 
 		 76 aa  44.7  0.0009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  32.47 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 78 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  30.26 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  31.17 
 
 		 122 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  31.75 
 
 		 95 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  32.2 
 
 		 86 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1223  putative glutaredoxin  34.78 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0714  glutaredoxin-like protein  42.86 
 
 		 91 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2324  glutaredoxin-like protein  34.48 
 
 		 85 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.365889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  26.39 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  30.56 
 
 		 260 aa  42  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0381  glutaredoxin  35.29 
 
 		 85 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  34.33 
 
 		 78 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  28.89 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4233  glutaredoxin-like protein  36.36 
 
 		 87 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2470  glutaredoxin-like protein  35.71 
 
 		 88 aa  42.4  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277033  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 		 80 aa  42  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 80 aa  42  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  31.17 
 
 		 121 aa  42  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  29.69 
 
 		 85 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  30.3 
 
 		 94 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2050  glutaredoxin-like protein  31.03 
 
 		 85 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  30.3 
 
 		 94 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  28.77 
 
 		 78 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  35.38 
 
 		 86 aa  41.6  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 		 80 aa  41.6  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4307  glutaredoxin-like protein NrdH  29.35 
 
 		 98 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  32.88 
 
 		 266 aa  41.2  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  28.77 
 
 		 78 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2040  glutaredoxin-like protein NrdH  28.38 
 
 		 83 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672826 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  28.77 
 
 		 78 aa  41.2  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 90 aa  41.2  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 85 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 88 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>