154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0807 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  90.64 
 
 		 203 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  90.15 
 
 		 203 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  73.89 
 
 		 203 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  40.39 
 
 		 202 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  45 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  44.5 
 
 		 200 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  41.36 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  43.35 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  40.98 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  31.43 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  33.96 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  33.96 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  33.96 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  34.26 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  35.85 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  34.91 
 
 		 137 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  34.26 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  26.17 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  31.13 
 
 		 135 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  26.17 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  30.19 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  27.1 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  30.56 
 
 		 169 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  28.83 
 
 		 130 aa  60.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  26.17 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  34.67 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  34.67 
 
 		 94 aa  57.8  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  32.2 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  34.21 
 
 		 82 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 86 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  35.8 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 87 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  36.23 
 
 		 87 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0418  GrxC family glutaredoxin  36.36 
 
 		 83 aa  51.2  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  36.23 
 
 		 87 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 86 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0664  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 83 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  35.53 
 
 		 86 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  35.53 
 
 		 86 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  35.53 
 
 		 86 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.57 
 
 		 459 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  27.38 
 
 		 442 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0448  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 81 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.328598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  32.86 
 
 		 85 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6184  glutaredoxin GrxC  36.11 
 
 		 81 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  29.49 
 
 		 128 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  28.3 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 82 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 82 aa  50.1  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 82 aa  50.1  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  31.65 
 
 		 87 aa  48.5  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  32.94 
 
 		 87 aa  48.5  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  28.57 
 
 		 90 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  28.95 
 
 		 88 aa  48.1  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 84 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  31.58 
 
 		 83 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  27.62 
 
 		 144 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  37.04 
 
 		 84 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 85 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  31.17 
 
 		 85 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  35.48 
 
 		 278 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 86 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  33.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  32.86 
 
 		 82 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 83 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4470  glutaredoxin  29.87 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.369575  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  29.87 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  32.86 
 
 		 85 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  25.61 
 
 		 89 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  27.5 
 
 		 84 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  33.75 
 
 		 87 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  34.69 
 
 		 154 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  31.25 
 
 		 89 aa  45.8  0.0004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  33.75 
 
 		 87 aa  45.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  32.1 
 
 		 85 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 82 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  36.11 
 
 		 84 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  33.82 
 
 		 81 aa  45.1  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 85 aa  43.9  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 83 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>