101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2960 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 125 aa  256  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  61.48 
 
 		 126 aa  153  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  61.54 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  58.82 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  70 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  36.89 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  38.27 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  41.43 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  30.12 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  37.5 
 
 		 391 aa  60.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  44.29 
 
 		 80 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2230  glutaredoxin  37.66 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381794  normal  0.448349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  40.58 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  40.58 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  41.43 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1501  hypothetical protein  36.99 
 
 		 398 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.226157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  25.41 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  28.46 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  36 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.57 
 
 		 384 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  42.86 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  38.36 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5740  glutaredoxin  35.38 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  38.36 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  28.95 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  37.5 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  38.36 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0566  glutaredoxin family protein  35 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.113719  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  40 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3366  glutaredoxin  30.77 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  34.57 
 
 		 194 aa  50.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  36.51 
 
 		 95 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  37.5 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  28.89 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1508  glutaredoxin-like protein protein, YruB  36.62 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00379246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  31.58 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  36.07 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  33.93 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  33.87 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  31.58 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  29.87 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.86 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2237  hypothetical protein  23.36 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  22.88 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3815  YruB family glutaredoxin-like protein  34.18 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0422  hypothetical protein  28.24 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  36 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  34.33 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  32.26 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  32.26 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  36.62 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0749  hypothetical protein  30.77 
 
 		 78 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0797842  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  38.03 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  31.43 
 
 		 402 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  36.62 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  36.62 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  28.4 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  29.11 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1123  glutaredoxin GrxC  31.65 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  28.77 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  31.25 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  36.62 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  36.62 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  35.21 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  35.21 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0496  glutaredoxin  30.86 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  28.36 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  31.65 
 
 		 260 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02490  glutaredoxin 3  31.88 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  27.63 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  36.76 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003681  glutaredoxin  35 
 
 		 76 aa  42  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0332  glutaredoxin  31.71 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.877113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2400  glutaredoxin, GrxC  32.89 
 
 		 87 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 311 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.28971  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0292  glutaredoxin  31.58 
 
 		 75 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  31.58 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  29.51 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  30 
 
 		 383 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  30.65 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  31.15 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0071  glutaredoxin  23.08 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00875586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0826  glutaredoxin 3  27.4 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  27.87 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  24.66 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  27.87 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  26.25 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  25.61 
 
 		 442 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.83 
 
 		 459 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2336  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 309 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.560711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3209  glutaredoxin 3  35.09 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.28852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.85 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2133  glutaredoxin family protein  31.25 
 
 		 87 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0860  hypothetical protein  32.5 
 
 		 82 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>