41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2856 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  100 
 
 		 221 aa  436  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  69 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  61.03 
 
 		 221 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  56.19 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  66.67 
 
 		 213 aa  204  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  59.76 
 
 		 218 aa  197  9e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  60.74 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  59.86 
 
 		 213 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  50.25 
 
 		 266 aa  174  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  51.32 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  42.78 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  34.38 
 
 		 162 aa  94.4  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  33.95 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  40.58 
 
 		 84 aa  50.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  29.89 
 
 		 133 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  33.66 
 
 		 121 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  27.63 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 85 aa  44.3  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  34.38 
 
 		 77 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  30.43 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  34.38 
 
 		 77 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  32.31 
 
 		 87 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 85 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  27.94 
 
 		 95 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  30.56 
 
 		 168 aa  42.7  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  30.77 
 
 		 87 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  30.3 
 
 		 87 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  31.82 
 
 		 86 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2413  glutaredoxin-like protein, YruB  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000497868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  35.62 
 
 		 122 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  37.88 
 
 		 245 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  31.58 
 
 		 125 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 85 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  26.32 
 
 		 78 aa  41.6  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  32.84 
 
 		 84 aa  41.6  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>