50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2615 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  100 
 
 		 229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  65.49 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  60.09 
 
 		 221 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  56.7 
 
 		 211 aa  202  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  61.78 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  61.11 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  61.38 
 
 		 218 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  59.59 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  55.48 
 
 		 266 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  47.65 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  48.67 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  35.03 
 
 		 162 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  35.62 
 
 		 179 aa  88.2  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 85 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 85 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 85 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  28.4 
 
 		 175 aa  48.9  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2919  glutaredoxin  32.05 
 
 		 134 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000608309 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  32 
 
 		 78 aa  46.2  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  35.38 
 
 		 88 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 84 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 84 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  37.88 
 
 		 84 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  38.46 
 
 		 86 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 89 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  33.33 
 
 		 121 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  35.82 
 
 		 85 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  29.23 
 
 		 85 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  36.11 
 
 		 84 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  34.25 
 
 		 122 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2812  glutaredoxin family protein  27.16 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0889237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 84 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  34.78 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  34.85 
 
 		 85 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  33.82 
 
 		 86 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  22.54 
 
 		 127 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  35.82 
 
 		 80 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  36.23 
 
 		 85 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 83 aa  42  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>