43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2157 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  55.44 
 
 		 221 aa  202  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  56.85 
 
 		 221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  56.19 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  56.7 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  53.89 
 
 		 211 aa  190  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  56.77 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  60.67 
 
 		 213 aa  188  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  46.23 
 
 		 266 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  46.52 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  46.47 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  34.48 
 
 		 162 aa  92.4  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  32.65 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0884  glutaredoxin  33.33 
 
 		 121 aa  45.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 84 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 85 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  36.36 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 85 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 87 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0716  glutaredoxin 3  33.77 
 
 		 83 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3376  glutaredoxin  30 
 
 		 122 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  32.84 
 
 		 89 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 89 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  34.85 
 
 		 84 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1859  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 87 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.543286  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  30.3 
 
 		 86 aa  42.7  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  33.85 
 
 		 86 aa  42  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  32 
 
 		 85 aa  42.4  0.006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2435  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 77 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2749  YruB family glutaredoxin-like protein  32 
 
 		 77 aa  42.4  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  31.34 
 
 		 85 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  35.94 
 
 		 85 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  33.33 
 
 		 84 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  29.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  30.88 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  30.88 
 
 		 247 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1155  glutaredoxin family protein  35.53 
 
 		 123 aa  41.6  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.698901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  33.85 
 
 		 88 aa  41.6  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  29.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3310  glutaredoxin 3  28.38 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.320297  normal  0.672061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  34.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>