21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3647 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  42.14 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  38.93 
 
 		 218 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  37.4 
 
 		 218 aa  95.1  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  34.46 
 
 		 205 aa  94.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  33.77 
 
 		 221 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  36.62 
 
 		 221 aa  91.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  35.46 
 
 		 229 aa  91.7  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  34.35 
 
 		 213 aa  90.5  9e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  40.2 
 
 		 266 aa  87  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  34.35 
 
 		 213 aa  84.7  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  35.56 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  37.78 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.75 
 
 		 175 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  27.85 
 
 		 80 aa  45.1  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1319  hypothetical protein  31.08 
 
 		 85 aa  44.3  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  45.24 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  32 
 
 		 78 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>