22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1650 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1650  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.734617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2133  hypothetical protein  46.71 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2207  hypothetical protein  41.94 
 
 		 221 aa  155  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2856  glutaredoxin  42.78 
 
 		 221 aa  151  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.667379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2615  glutaredoxin  48.67 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.930199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2130  glutaredoxin  49.65 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2457  glutaredoxin  48.68 
 
 		 213 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1652  glutaredoxin  49.29 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1924  glutaredoxin  46.24 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3985  glutaredoxin  47.02 
 
 		 266 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.28691  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2157  glutaredoxin  50 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  33.94 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2434  hypothetical protein  30.66 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.332001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  29.89 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1319  hypothetical protein  32.47 
 
 		 85 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.228979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  29.87 
 
 		 80 aa  46.2  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  31.08 
 
 		 78 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  32 
 
 		 84 aa  45.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  24.05 
 
 		 80 aa  43.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 80 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  26.25 
 
 		 82 aa  42  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  30.77 
 
 		 80 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>