More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1609 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  56.76 
 
 		 80 aa  98.6  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  58.57 
 
 		 84 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  58.57 
 
 		 84 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  54.55 
 
 		 77 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  51.32 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  54.93 
 
 		 81 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  48.65 
 
 		 80 aa  88.6  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  47.3 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 		 194 aa  83.6  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  44.59 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  45.83 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  45.21 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  48 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0505  glutaredoxin-like protein, YruB-family  44 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  42.67 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  41.89 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  38.75 
 
 		 384 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3102  glutaredoxin 3  41.18 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  36.99 
 
 		 383 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  41.79 
 
 		 92 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2960  YruB family glutaredoxin-like protein  41.43 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000757136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  44.12 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4099  glutaredoxin  37.33 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5216  glutaredoxin 3  45.59 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.112627  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3049  glutaredoxin  39.44 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0044  glutaredoxin 3  45.59 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31587  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0640  putative glutaredoxin  40.58 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.189959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5953  glutaredoxin 3  44.12 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3277  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3601  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.186342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0169  glutaredoxin  39.44 
 
 		 402 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2064  glutaredoxin  34.25 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  42.65 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  37.84 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  39.71 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  38.57 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  36.9 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2772  glutaredoxin 3  39.47 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  38.81 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  44.12 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  42.19 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  40.3 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2866  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  44.12 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2241  glutaredoxin GrxC  38.16 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747131  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  43.28 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2855  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  39.71 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  43.84 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2910  glutaredoxin 3  39.47 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0355  glutaredoxin 3 (GRX3) protein  39.71 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  38.24 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  37.31 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  38.81 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  40.3 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  41.79 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  38.24 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2784  glutaredoxin  37.7 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.420129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  35.82 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  37.31 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  37.31 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  38.24 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  38.24 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3206  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0480  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2840  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1413  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0499  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0179  glutaredoxin 3  38.16 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  36.11 
 
 		 260 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  34.21 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  41.18 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  39.71 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>