19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2339 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  25.9 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1459  hypothetical protein  29.89 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  28.87 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2439  hypothetical protein  30.11 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.911214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2002  hypothetical protein  30.81 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0966406  normal  0.742672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  21.21 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  31.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3371  hypothetical protein  28.07 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  25.34 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2760  hypothetical protein  26.83 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  37.5 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  27.4 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1858  transmembrane protein  25.69 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  26.9 
 
 		 157 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  23.6 
 
 		 138 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2549  hypothetical protein  30.19 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00444447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1259  hypothetical protein  29.56 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31261  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  26.32 
 
 		 140 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>