39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4894 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  275  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  92.14 
 
 
140 aa  254  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  49.64 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  26.24 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  33.59 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  33.08 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  40.2 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0268  hypothetical protein  40.68 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  48 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0260  hypothetical protein  40.68 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0268  hypothetical protein  40.68 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0263  hypothetical protein  40.68 
 
 
168 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.624489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  33.06 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  26.06 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  31.03 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  42.86 
 
 
186 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  29.41 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0373  hypothetical protein  47.83 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  25.69 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  60 
 
 
230 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0184  hypothetical protein  57.58 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  37.21 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  29.45 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  26.57 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  43.48 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3647  hypothetical protein  45.24 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2060  putative transmembrane protein  29.93 
 
 
181 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  53.12 
 
 
150 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0258  hypothetical protein  36 
 
 
272 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  27.68 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  47.5 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  43.9 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  26.32 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
501 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1993  hypothetical protein  39.02 
 
 
224 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  44.44 
 
 
196 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>