13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2546 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  304  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  30.14 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  31.06 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  27.27 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  28.47 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.79 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  27.97 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  23.88 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  26.23 
 
 		 147 aa  42  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  23.42 
 
 		 125 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  23.89 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>