24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1728 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  257  3e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  96.8 
 
 
125 aa  249  7e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0528  hypothetical protein  53.33 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485368  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  44.83 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  27.14 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  27.34 
 
 
154 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  26.95 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  28.12 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0205  hypothetical protein  37.08 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228683  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  28.46 
 
 
155 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  26.32 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  24.82 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  26.92 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  27.07 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  25.38 
 
 
155 aa  42  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  24.63 
 
 
158 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  23.66 
 
 
144 aa  41.2  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  23.89 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  26.81 
 
 
156 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5609  peptidase M23B  43.18 
 
 
298 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.610069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>