29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0528 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0528  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  250  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485368  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  53.45 
 
 		 125 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  53.45 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  50.41 
 
 		 134 aa  94.7  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  27.14 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  27.14 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  27.14 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  50.8  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  34.17 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  29.69 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  27.34 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  26.83 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  30 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  26.92 
 
 		 187 aa  43.5  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  24.67 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  27.64 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  23.61 
 
 		 154 aa  42.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  24.31 
 
 		 144 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  25.41 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  22.93 
 
 		 161 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  40.48 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  25.18 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  29.61 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>