33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2990 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  320  5e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  98.7 
 
 		 154 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  93.51 
 
 		 154 aa  301  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  77.92 
 
 		 154 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  64.52 
 
 		 155 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  64.52 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  63.87 
 
 		 155 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  63.87 
 
 		 155 aa  203  8e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  61.94 
 
 		 155 aa  196  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  54.11 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  53.42 
 
 		 150 aa  147  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  51.37 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  53.38 
 
 		 187 aa  144  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  49.25 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  48.97 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  44.12 
 
 		 151 aa  124  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  29.73 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  30.34 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  26.24 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  26.95 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  30.07 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.67 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  29.79 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  30.3 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  26.38 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  30.95 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  38.33 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  28.91 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  24 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  25.3 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2739  hypothetical protein  32.69 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1799  hypothetical protein  30.43 
 
 		 253 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.627108  normal  0.339394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0528  hypothetical protein  26.36 
 
 		 124 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485368  normal  0.376375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>