38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1005 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  296  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  62.18 
 
 		 156 aa  166  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  62 
 
 		 150 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  49.3 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  50.34 
 
 		 138 aa  143  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  52.42 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  50.81 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  38.52 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  33.57 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  33.99 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  30.14 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  49.28 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  29.86 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  29.58 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  31.34 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  31.17 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  30.08 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  30.52 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  29.86 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0898  hypothetical protein  39.39 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  29.87 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  27.33 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  28.75 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  37.1 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  23.68 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  28.26 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00586  hypothetical protein  42.11 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  29.55 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001906  hypothetical protein  31.34 
 
 		 193 aa  44.3  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.661466  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0636  hypothetical protein  42.5 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00424939  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  25 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  23.66 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  25.6 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>