20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2860 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  309  7.999999999999999e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  54.93 
 
 		 154 aa  151  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  54.79 
 
 		 154 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  54.23 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  53.42 
 
 		 154 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  48.03 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  48.03 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  48.03 
 
 		 155 aa  140  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  48.03 
 
 		 155 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  49.33 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  46.71 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  47.71 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  47.37 
 
 		 187 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  39.69 
 
 		 148 aa  117  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  40 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  29.79 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  28 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  28.06 
 
 		 157 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  51.02 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  41.86 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>