26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0670 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  306  5.9999999999999995e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  51.37 
 
 		 154 aa  147  6e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  54.41 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  54.41 
 
 		 155 aa  146  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  54.41 
 
 		 155 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  51.37 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  53.68 
 
 		 155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  53.1 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  52.05 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  53.49 
 
 		 187 aa  140  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  51.11 
 
 		 154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  49.33 
 
 		 150 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  45.71 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  52.8 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  43.7 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  35.43 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  28.78 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  30.37 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  26.06 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  26.35 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  27.21 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  27.27 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0205  hypothetical protein  32.29 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228683  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  31.46 
 
 		 163 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  25.2 
 
 		 138 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  26.62 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>