29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1025 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  321  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  91.61 
 
 		 155 aa  296  8e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  91.61 
 
 		 155 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  90.97 
 
 		 155 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  90.32 
 
 		 155 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  62.58 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  61.94 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  61.94 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  59.35 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  53.59 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  53.1 
 
 		 147 aa  144  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  53.49 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  52.38 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  52.67 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  47.71 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  39.29 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  28.79 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  30.46 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  23.53 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  27.14 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  29.32 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2319  hypothetical protein  26.97 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  27.34 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  28.46 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  25.78 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  27.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  28.46 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0528  hypothetical protein  27.34 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.485368  normal  0.376375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  26.77 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>