30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3496 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  298  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  64.34 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  53.42 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  53.42 
 
 		 155 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  52.74 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  55.22 
 
 		 155 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  52.7 
 
 		 155 aa  147  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  52.52 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  50.34 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  49.66 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  48.97 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  49.29 
 
 		 147 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  49.61 
 
 		 187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  46.43 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  124  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2860  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  31.88 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  30.37 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  30.87 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  26.71 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  28.8 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  26.81 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  28.69 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  31.15 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1795  hypothetical protein  24.11 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  25.6 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  24.8 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1728  hypothetical protein  25.53 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  34.21 
 
 		 178 aa  40  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>