42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0845 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  88.41 
 
 		 147 aa  207  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  50.35 
 
 		 138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  49.65 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  49.64 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  41.55 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  51.15 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  36.36 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  33.86 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1127  hypothetical protein  32.56 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0795312  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  28.37 
 
 		 154 aa  57  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  29.79 
 
 		 154 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  29.79 
 
 		 154 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  32.39 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  27.08 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  29.33 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  32.59 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  33.83 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  41.1 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1020  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000462608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1089  hypothetical protein  28.17 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000360525  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1122  hypothetical protein  27.78 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000205985  normal  0.233923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1025  hypothetical protein  25.33 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000544137  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3269  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575849  normal  0.0306422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3719  hypothetical protein  28.91 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000989384  normal  0.0383104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  25.35 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03187  hypothetical protein  26.95 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1619  putative transmembrane protein  28.66 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3162  hypothetical protein  29.01 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000326454  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3912  hypothetical protein  26.47 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.385764  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2546  hypothetical protein  25.74 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0786863  hitchhiker  0.000802946 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  34.69 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0898  hypothetical protein  32.65 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2339  hypothetical protein  24.68 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.134432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  30.36 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  57.14 
 
 		 544 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0696  hypothetical protein  31.58 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0526  hypothetical protein  26.12 
 
 		 162 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.182831 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0521  hypothetical protein  26.12 
 
 		 162 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>