33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1508 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  59.57 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42530  hypothetical protein  41.76 
 
 
140 aa  57.8  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  41.07 
 
 
158 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2601  hypothetical protein  41.38 
 
 
151 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000020827  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4789  hypothetical protein  37.7 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0307864  hitchhiker  0.00167919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1142  hypothetical protein  27.39 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2990  hypothetical protein  38.33 
 
 
154 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000446281  normal  0.422538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3071  hypothetical protein  38.33 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0110904  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0851  hypothetical protein  51.16 
 
 
544 aa  47  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5412  hypothetical protein  44.44 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  38.46 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3257  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0048  PKD domain containing protein  44.9 
 
 
217 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62170  hypothetical protein  32.91 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.157561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3168  hypothetical protein  29 
 
 
154 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000633672  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2946  hypothetical protein  26.97 
 
 
151 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125573  normal  0.0151301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1246  putative lipoprotein  47.5 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  38.75 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0845  hypothetical protein  66.67 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4894  hypothetical protein  47.37 
 
 
140 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3425  hypothetical protein  28.85 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.31492 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3706  hypothetical protein  72 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1316  hypothetical protein  32.29 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1319  hypothetical protein  32.29 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0670  hypothetical protein  31.46 
 
 
147 aa  42  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00376699  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1263  hypothetical protein  35.16 
 
 
187 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0980  hypothetical protein  60 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  42.11 
 
 
140 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3576  hypothetical protein  29.23 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3496  hypothetical protein  41.03 
 
 
144 aa  40.8  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00242449  hitchhiker  0.00393071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1993  hypothetical protein  35.85 
 
 
224 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2624  hypothetical protein  47.37 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>