18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2821 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  358  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  48.9 
 
 
177 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  35.58 
 
 
242 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  35.08 
 
 
193 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  35.33 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  33.86 
 
 
184 aa  111  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  32.07 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  31.67 
 
 
176 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  29.94 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  27.98 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  30.11 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  29.79 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  48.48 
 
 
202 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  26.99 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  25.29 
 
 
176 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1508  hypothetical protein  40.28 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0660289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0284  hypothetical protein  48.48 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0262  hypothetical protein  39.62 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>