17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1901 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  83.7 
 
 		 179 aa  275  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  36.51 
 
 		 178 aa  120  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  33.7 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  28.44 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  31.02 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  28.28 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  29.38 
 
 		 193 aa  62  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  28.02 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  28.16 
 
 		 169 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  27.81 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  31.06 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  27.68 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1638  hypothetical protein  33.75 
 
 		 129 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3301  hypothetical protein  32.93 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  30.83 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>