16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1424 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  51.06 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  48.65 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  39.88 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  36.21 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  27.18 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  30.48 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  30.57 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  27.6 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  24.37 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  25.89 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  23.5 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1638  hypothetical protein  35.82 
 
 		 129 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  26.51 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3301  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  42  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  24.85 
 
 		 189 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>