16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2322 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  360  9e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  80.98 
 
 		 184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  36.26 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  36.93 
 
 		 177 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  28.96 
 
 		 242 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  27.96 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  29.52 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  30.65 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  26.92 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  32.56 
 
 		 171 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  29.89 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  33.07 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  28.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1638  hypothetical protein  25.61 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  45.1 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  24.44 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>