17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2039 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  347  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  48.59 
 
 
180 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  50 
 
 
187 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  46.01 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  41.72 
 
 
171 aa  132  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  31.67 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  30.39 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  37.4 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  28.4 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  30.48 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  29.38 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  26.53 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  27.96 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2283  hypothetical protein  45.45 
 
 
185 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3562  hypothetical protein  54.55 
 
 
144 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56190  hypothetical protein  25.86 
 
 
140 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>