18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2047 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  48.9 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  38.79 
 
 		 242 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  35.52 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  34.44 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  32.43 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  31.72 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  30.39 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  26.92 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  29.45 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  29.09 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  40.43 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0485  hypothetical protein  29.06 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  25.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  26.13 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  36.54 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  29.78 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2283  hypothetical protein  34.88 
 
 		 185 aa  40.8  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>