17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1043 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  80.69 
 
 		 189 aa  313  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  42.16 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  35.03 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  26.87 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  39.22 
 
 		 176 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  37.04 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  26.77 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  45.1 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  43.4 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0262  hypothetical protein  32.89 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  26.67 
 
 		 180 aa  45.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0485  hypothetical protein  27.61 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192807  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1005  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.368062  hitchhiker  0.00000000000106362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  41.3 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1638  hypothetical protein  31.07 
 
 		 129 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0881  hypothetical protein  48.65 
 
 		 158 aa  42  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00160834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>