13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2402 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  35.08 
 
 		 178 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  35.52 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  34.45 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  28.74 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  28.11 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  26.87 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  26.53 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  28.65 
 
 		 179 aa  62  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  25.58 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  26.13 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  30.16 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  25.83 
 
 		 176 aa  41.6  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>