18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1582 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  84 
 
 		 169 aa  274  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  40.8 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  39.11 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  38.95 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  32.07 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1156  hypothetical protein  34.48 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  30.05 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  32.02 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  26.64 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  27.38 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  23.56 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  28.09 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3562  hypothetical protein  41.25 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1638  hypothetical protein  39.47 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000846806  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  30.77 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3301  hypothetical protein  37.33 
 
 		 196 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  46.88 
 
 		 192 aa  41.2  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>