46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1982 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  100 
 
 		 192 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1732  aspartyl protease-like protein  51.58 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  35.26 
 
 		 291 aa  101  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1484  hypothetical protein  29.89 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3025  hypothetical protein  45.08 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4032  hypothetical protein  33.61 
 
 		 339 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000100028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3947  hypothetical protein  34.43 
 
 		 338 aa  67.8  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1582  hypothetical protein  55.56 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  25.74 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  38.89 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1424  hypothetical protein  56.1 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  38.27 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  33 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1041  hypothetical protein  26.77 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.542193  normal  0.878217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  25 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  30.21 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  52.78 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1226  hypothetical protein  41.3 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745865 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  32.98 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  30.12 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  32.32 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  33.33 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4041  hypothetical protein  26.45 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.72027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  34.38 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  32.32 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  38 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  26.77 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  35.71 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  31.91 
 
 		 233 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0027  hypothetical protein  26.36 
 
 		 405 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  45.95 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  26.32 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  25.9 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  32.22 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  36.9 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  33.68 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  31.4 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  28.92 
 
 		 230 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  28.92 
 
 		 230 aa  41.6  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  34.88 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  39.58 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3541  hypothetical protein  35.8 
 
 		 313 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  22.16 
 
 		 174 aa  41.2  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  35.71 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>