13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3220 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  380  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0165343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1043  hypothetical protein  80.69 
 
 		 202 aa  298  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0297225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1995  hypothetical protein  41.62 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000089433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2821  hypothetical protein  31.38 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000141194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2047  hypothetical protein  27.46 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144748  hitchhiker  0.000000493241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2322  hypothetical protein  42.59 
 
 		 179 aa  51.2  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000915732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1901  hypothetical protein  40.74 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.355914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2039  hypothetical protein  26.84 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2402  hypothetical protein  27.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0459  hypothetical protein  48.15 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0262  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  46.2  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2652  hypothetical protein  25.29 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0485  hypothetical protein  27.61 
 
 		 208 aa  41.2  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0192807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>