29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0310 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  44.66 
 
 		 249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  41 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  42.39 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  34.68 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  41.12 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  35.24 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  37.86 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  36.07 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3486  hypothetical protein  31.63 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.641158  normal  0.334004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  37.33 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2617  hypothetical protein  31.63 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3083  hypothetical protein  33.64 
 
 		 391 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  30.25 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  32.98 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  30.25 
 
 		 191 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4231  aspartyl protease-like protein  36.56 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4194  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 515 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233641  normal  0.0358885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0227  hypothetical protein  36.11 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.127334  normal  0.186185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  30.77 
 
 		 425 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  35.35 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  34.44 
 
 		 174 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  33.02 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  26.77 
 
 		 192 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  31.94 
 
 		 170 aa  42.7  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  37.63 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3643  PDZ/DHR/GLGF domain protein  25.34 
 
 		 413 aa  42.7  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  29.6 
 
 		 291 aa  42.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  35.71 
 
 		 215 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>