46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3391 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  100 
 
 		 425 aa  875    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  35.83 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0027  hypothetical protein  26.33 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  28.97 
 
 		 175 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  35.64 
 
 		 181 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  29.17 
 
 		 170 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  34.02 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  34.58 
 
 		 234 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  31.13 
 
 		 166 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  29.91 
 
 		 169 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  28.67 
 
 		 169 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  30.3 
 
 		 174 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  28.46 
 
 		 175 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  50.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  30.97 
 
 		 161 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  29.06 
 
 		 169 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2520  hypothetical protein  30.83 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000179634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1829  hypothetical protein  30.83 
 
 		 426 aa  49.3  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  32.14 
 
 		 158 aa  48.5  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  29.13 
 
 		 173 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  29.51 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  26.17 
 
 		 169 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0703  hypothetical protein  30.16 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  30.7 
 
 		 172 aa  47  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  30.28 
 
 		 160 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  28.71 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  28.71 
 
 		 172 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  29.91 
 
 		 156 aa  45.1  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  28.87 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  26.96 
 
 		 214 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  26.55 
 
 		 174 aa  45.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  30 
 
 		 172 aa  45.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  26.92 
 
 		 172 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  25.96 
 
 		 172 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  29.31 
 
 		 232 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1484  hypothetical protein  29.81 
 
 		 212 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  27.45 
 
 		 163 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  27.45 
 
 		 163 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  25.42 
 
 		 171 aa  43.9  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3307  hypothetical protein  28.81 
 
 		 190 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.370984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  26.43 
 
 		 191 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  28.15 
 
 		 189 aa  43.5  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  30 
 
 		 173 aa  43.5  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>