84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3634 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  314  4e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  38.06 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  34.94 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  38.66 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  37.3 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  38.66 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  36.24 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  35.86 
 
 		 172 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  38.66 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  40.34 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  36.91 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  35.33 
 
 		 191 aa  67  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  37.74 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  39.39 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  37.74 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4231  aspartyl protease-like protein  39.5 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  37.12 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  37.82 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  32.64 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  35.29 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  34.25 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  39.67 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  33.33 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  31.58 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  35.96 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  30.33 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  32.86 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  32.86 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  34.78 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  32.08 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  31.15 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  29.41 
 
 		 188 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  29.57 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  35.78 
 
 		 215 aa  51.2  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  34.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  36.97 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  31.09 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  32 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  32.41 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  30.88 
 
 		 192 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  35.78 
 
 		 244 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  34.17 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  36.92 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  29.46 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  35.11 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  35.92 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  35.2 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  27.35 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  30.28 
 
 		 425 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2044  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0213707  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  31.67 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  29.8 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  31.65 
 
 		 261 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3397  hypothetical protein  33.06 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.028147  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  28.83 
 
 		 171 aa  44.7  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4258  putative transmembrane signal peptide protein  32.71 
 
 		 245 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  40.91 
 
 		 342 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  36.11 
 
 		 235 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  35.71 
 
 		 231 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  34.82 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  31.48 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3060  Peptidase A2A, retrovirus RVP subgroup  32.29 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.739979  normal  0.289457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1207  aspartyl protease-like  40 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0487674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2183  putative exported protein of unknown function  37.19 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  37.72 
 
 		 233 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  31.2 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4409  hypothetical protein  32.18 
 
 		 362 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  31.25 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1732  aspartyl protease-like protein  37 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  28.85 
 
 		 230 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  35.8 
 
 		 232 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  36.84 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  31.3 
 
 		 173 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  28.7 
 
 		 216 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4782  hypothetical protein  29.31 
 
 		 221 aa  40.8  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0468476  normal  0.490808 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0300  hypothetical protein  30.53 
 
 		 379 aa  40.8  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.299271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>