102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0303 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  88.24 
 
 		 169 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  74.71 
 
 		 169 aa  247  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  73.41 
 
 		 173 aa  238  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  71.69 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  67.43 
 
 		 175 aa  232  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  68 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  44.12 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  39.08 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2562  aspartyl protease-like protein  36.02 
 
 		 269 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  45.45 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  34.3 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  46.28 
 
 		 230 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  43.44 
 
 		 169 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  36.05 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  37.58 
 
 		 169 aa  97.4  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  37.7 
 
 		 234 aa  90.9  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  37.5 
 
 		 220 aa  90.1  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  37.5 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  35.47 
 
 		 170 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  37.07 
 
 		 166 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  40.68 
 
 		 231 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  33.53 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  35.26 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  35.67 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  31.93 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  40.34 
 
 		 235 aa  77.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  35.12 
 
 		 230 aa  77.4  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  40.52 
 
 		 215 aa  77.4  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2183  putative exported protein of unknown function  35.83 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  39.17 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  35.54 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  40.16 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  38.02 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  34.9 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4258  putative transmembrane signal peptide protein  36 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105923 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  31.48 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  32.53 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3465  hypothetical protein  37.12 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3397  hypothetical protein  35.54 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.028147  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  40.34 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  36.36 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  28.49 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  36.36 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  36.09 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  32.74 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  36.09 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  32.3 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2044  hypothetical protein  34.71 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0213707  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  35.8 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  34.57 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  35.61 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  34.57 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  33.05 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  39.42 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  32.3 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  38.39 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  34.34 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  25.47 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  40.17 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  34.78 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  34.43 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  39.82 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  31.33 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  32.3 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  33.6 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  32.5 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4782  hypothetical protein  39.02 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0468476  normal  0.490808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  33.95 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  34.68 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  30.64 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  33.55 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  31.67 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  35.51 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  30.7 
 
 		 188 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  32.35 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  32.35 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  29.89 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  36.28 
 
 		 161 aa  62  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0585  hypothetical protein  34.45 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.013644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  35.04 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  29.33 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  29.88 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  30.71 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  31.34 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  36.36 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  33.04 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  33.64 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  34.26 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  29.17 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  43.02 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1207  aspartyl protease-like  38.52 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0487674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  34.48 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  32.79 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4231  aspartyl protease-like protein  32.52 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>