105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0602 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  100 
 
 		 174 aa  348  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  76.74 
 
 		 174 aa  267  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  76.58 
 
 		 161 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0553  hypothetical protein  61.05 
 
 		 173 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  61.9 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  63.1 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  61.31 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4961  hypothetical protein  59.88 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  59.52 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  58.14 
 
 		 174 aa  210  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  50.89 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  47.06 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  44.64 
 
 		 172 aa  141  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  42.53 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  51.85 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  45.78 
 
 		 180 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  34.55 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  33.95 
 
 		 163 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  41.29 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  42.5 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  46.22 
 
 		 214 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4782  hypothetical protein  39.83 
 
 		 221 aa  85.1  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0468476  normal  0.490808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  41.09 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  37.29 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  39.66 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  38.66 
 
 		 217 aa  80.9  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  39.5 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  41.32 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  39.5 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  40.16 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  40.52 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  38.71 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  39.66 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  40.5 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  40 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  36.84 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  37.82 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  40.16 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  38.79 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  36.84 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  35.98 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  34.4 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3465  hypothetical protein  38.14 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  37.8 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  34.45 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  38.79 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  31.03 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  40.71 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  35.59 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  34.43 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  32.64 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  32.59 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  36.28 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2562  aspartyl protease-like protein  36.29 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  30.56 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1207  aspartyl protease-like  28.32 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0487674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  34.17 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  36.13 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  36.13 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  31.01 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  36.09 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  32 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  36.04 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  30.52 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  33.06 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4231  aspartyl protease-like protein  28.57 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  27.33 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  34.71 
 
 		 233 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  35.96 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  26.89 
 
 		 171 aa  52.8  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0391  hypothetical protein  37.97 
 
 		 181 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  33.85 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  29.89 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  30.46 
 
 		 230 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  34.43 
 
 		 230 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  28.68 
 
 		 173 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  29.89 
 
 		 230 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  36.07 
 
 		 261 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  34.71 
 
 		 233 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  33.97 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  32.41 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  29.38 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01167  peptidase A2A, retrovirus, catalytic  27.83 
 
 		 409 aa  48.5  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.385581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0585  hypothetical protein  29.91 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.013644 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  31.13 
 
 		 184 aa  47.8  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  34.68 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  29.84 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  26.67 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4258  putative transmembrane signal peptide protein  34.4 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105923 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  30.34 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  28.29 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3397  hypothetical protein  31.31 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.028147  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3391  putative peptidase A2A  26.55 
 
 		 425 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  30.84 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2763  peptidase A2A  32.43 
 
 		 342 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167173 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>