105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1124 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  89.53 
 
 		 191 aa  330  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  89.01 
 
 		 191 aa  328  4e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0952  hypothetical protein  51.3 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0256489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0905  hypothetical protein  50.53 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19223  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1817  hypothetical protein  47.92 
 
 		 192 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1347  hypothetical protein  49.4 
 
 		 194 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.156932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2473  hypothetical protein  35.48 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.964119  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0478  hypothetical protein  37.93 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1054  hypothetical protein  34.44 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0548  hypothetical protein  35.04 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.480167  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2013  hypothetical protein  34.63 
 
 		 235 aa  91.7  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.620932  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0864  hypothetical protein  31.55 
 
 		 234 aa  89.7  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2363  hypothetical protein  32.39 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0236  hypothetical protein  35.34 
 
 		 171 aa  89.4  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.94297  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0855  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1975  putative transmembrane signal peptide protein  34.83 
 
 		 230 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2044  hypothetical protein  35.94 
 
 		 166 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0455  hypothetical protein  39.23 
 
 		 193 aa  87  1e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0956  hypothetical protein  43.44 
 
 		 244 aa  85.5  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.246456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2321  hypothetical protein  32.64 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2084  hypothetical protein  32.64 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347175  normal  0.824973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  33.99 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7351  putative protease  33.73 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0265  putative aspartyl protease  40.16 
 
 		 261 aa  78.2  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.556138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0457  hypothetical protein  30.41 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  33.66 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1606  putative transmembrane signal peptide protein  35.79 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284627  normal  0.150765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  33.17 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1550  hypothetical protein  31.84 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3026  hypothetical protein  35.45 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.300104  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4379  putative transmembrane signal peptide protein  34.29 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0360  hypothetical protein  34.17 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0535  conserved hypothetical protein; putative signal peptide; putative protease  35.83 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3772  putative transmembrane signal peptide protein  36.3 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3770  hypothetical protein  36.67 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1595  hypothetical protein  35.2 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4258  putative transmembrane signal peptide protein  31.38 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2391  putative protease  42.34 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal  0.0115884 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1241  peptidase aspartic family  36.07 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0576  hypothetical protein  39.6 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0506  hypothetical protein  32.5 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.480359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1468  hypothetical protein  33.9 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2662  hypothetical protein  32.82 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1211  hypothetical protein  33.9 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4853  hypothetical protein  34.17 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.660743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2183  putative exported protein of unknown function  33.9 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3458  hypothetical protein  35.16 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.220051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2820  putative protease  33.13 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4466  hypothetical protein  30.95 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.115981  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1207  aspartyl protease-like  32.53 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0487674  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2062  hypothetical protein  30.6 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0303  hypothetical protein  31.67 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0830105  normal  0.23764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3451  hypothetical protein  37.12 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4231  aspartyl protease-like protein  37.19 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3040  peptidase  31.67 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0232  hypothetical protein  31.03 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3397  hypothetical protein  33.02 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.028147  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4178  hypothetical protein  30.16 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1079  hypothetical protein  34.15 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.524311  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1424  aspartyl protease-like protein  32.03 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2044  hypothetical protein  30.53 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0213707  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1315  hypothetical protein  31.34 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.037732  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3346  hypothetical protein  30.71 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  31.1 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11490  hypothetical protein  37.39 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1053  hypothetical protein  37.04 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2562  aspartyl protease-like protein  30.77 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0877  hypothetical protein  32.73 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2241  hypothetical protein  30.08 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5694  hypothetical protein  31.01 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2751  hypothetical protein  30.08 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.448599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1853  hypothetical protein  35.96 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3465  hypothetical protein  29.6 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0602  aspartyl protease-like protein  31.01 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3849  aspartyl protease-like protein  37.04 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03229  predicted aspartyl protease  29.75 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0206524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2283  hypothetical protein  31.93 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65630  hypothetical protein  30.38 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.411322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3664  aspartyl protease-like protein  33.08 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61262  normal  0.121964 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1566  aspartyl protease-like protein  32.52 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4105  aspartyl protease  31.21 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1988  hypothetical protein  29.85 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1983  hypothetical protein  29.85 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0311  hypothetical protein  26.11 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4789  hypothetical protein  31.41 
 
 		 172 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0567723  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4812  hypothetical protein  30.23 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4631  peptidase A2A retrovirus catalytic  35.16 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1922  peptidase A2A  27.97 
 
 		 158 aa  51.2  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.331274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4913  hypothetical protein  31.41 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0585  hypothetical protein  33.63 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.013644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4966  hypothetical protein  31.21 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.590906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2135  hypothetical protein  29.27 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000225345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  33 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1732  aspartyl protease-like protein  31.07 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4705  hypothetical protein  30.13 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.103794  normal  0.943314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0502  hypothetical protein  28.85 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106404  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0310  hypothetical protein  32.98 
 
 		 235 aa  44.7  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1155  hypothetical protein  28.57 
 
 		 249 aa  44.7  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>