17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1732 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1732  aspartyl protease-like protein  100 
 
 		 189 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1982  aspartyl protease-like protein  52.11 
 
 		 192 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0789  hypothetical protein  29.57 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1484  hypothetical protein  27.72 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3025  hypothetical protein  36.59 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4032  hypothetical protein  27.04 
 
 		 339 aa  62  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000100028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3947  hypothetical protein  32.54 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0678  putative aspartyl protease  30.23 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.408467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1124  aspartyl protease-like protein  31.07 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0950664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3935  hypothetical protein  29.66 
 
 		 361 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00372357  hitchhiker  0.000463304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2153  hypothetical protein  31.11 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2897  hypothetical protein  30.1 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.905057  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1541  hypothetical protein  27.13 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.178646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3634  hypothetical protein  37 
 
 		 160 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00176543  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0907  putative transmembrane signal peptide protein  30.93 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0170092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0868  putative transmembrane signal peptide protein  30.93 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.174199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0841  conserved hypothetical transmembrane signal peptide protein  30.84 
 
 		 230 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.414493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>